由MAPkinase1(MEK1)调控的丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路的激活与许多癌症的发生和进展有关。此外,有报道称两个活跃的突变(P124S和E203K)增强了MEK1的活性,从而最终导致癌症的肿瘤发生。曲美替尼是一种MEK1抑制剂,用于治疗eml4-alk阳性、egfr激活和kras突变型肺癌。因此,本研究通过分子对接和分子动力学(MD)模拟,探讨非活性突变(A52V/P124S和E203K)对MEK1构象变化的影响以及MEK1与曲美替尼相互作用的变化。
此外,还进一步利用了引导分子动力学(SMD)模拟来比较曲美替尼从野生型(WT)MEK1和两个活性突变体(P124S和E203K)的解离过程。因此,与非活性MEK1(WT和A52V突变体)相比,曲美替尼与两个活性突变体(P124S和E203K)的相互作用更强。此外,两个活性突变体可能使MEK1的变容通道比非活性型(WT和A52V突变体)更宽更短。
因此,与WTMEK1相比,曲美替尼更容易与活性突变体(P124S和E203K)分离。综上所述,我们的理论结果表明,活跃的突变可能会减弱MEK抑制剂(曲美替尼)对MEK1的抑制作用,这可能是未来抗癌治疗的关键线索。
然而,迄今为止尚未发现与MEK1结合的曲美替尼的x射线晶体结构。曲美替尼和cobimetinib是MEK1的III型别构抑制剂,因为它们可以与ATP结合袋相邻结合。此外,它们是相对于ATP的稳态非竞争性抑制剂,因为ATP不能阻止它们与MEK1的相互作用。已有研究报道了MEK1中P124S和E203K的突变,可增强MEK1的催化活性,从而增加MEK1的磷酸化,促进肿瘤发生。
而一些突变(如A52V)已经确认在体外不激活,因为A52与野生型3D结构中的激酶结构域没有强烈的相互作用。然而,MEK1不同区域突变对其空间结构的影响尚不清楚。为此,本研究通过对接研究确定曲美替尼与MEK1(PDBID3SLS)的结合姿势。此外,我们还通过分子动力学(MD)模拟研究了曲美替尼结合变构位点时野生型(WT)MEK1和3个突变体(A52V、P124S和E203K)的构象变化。
最后,我们进行了引导分子动力学(SMD)模拟来研究曲美替尼Trametinib从WTMEK1和3个突变体(A52V、P124S和E203K)的解离。希望我们的结果可以为设计新的RAS-RAF-MEK-ERK通路抑制剂提供一些有用的线索。详情请扫码咨询:
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