第一代针对甲状腺癌的靶向药是2000年后开始研发的，在2010-2015期间被批准在美国上市，包括：用于治疗乳头状癌/滤泡状癌/嗜酸细胞癌的索拉非尼和乐伐替尼；用于治疗髓样癌的凡德他尼和卡博替尼。第一代靶向药填补了之前无药可用的空白，除索拉非尼之外的三款药有效率也都说得过去，但它们针对的是一些普遍存在的靶点，也就是所有需要靶向的病人都可以用。
这也带来一个问题：药物副作用比较大，60-80%服药的患者身上出现了明显的副作用，10-20%服药的患者因为副作用不得不终止服药。因为第一代靶向药巨大的副作用，所以2010年后开始了第二代靶向药的研发。2018年第一款二代靶向药拉罗替尼（Loxo-101）已经在美国上市。
和第一代靶向药针对性不强不同，第二代靶向药选择的依据是肿瘤不同的基因突变。比如针对BRAF基因突变的患者，使用的是达拉菲尼&曲美替尼组合；针对NTRK基因融合的患者，使用的是拉罗替尼。相比一代靶向药，二代靶向药的客观缓解率有了明显提升，更重要的是显著副作用比例明显下降。
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