联合治疗在给患者带来更多的选择的同时，也带来了如何优选的问题。比如在同一瘤种中治疗模式如何选择，以肾细胞癌为例，双向免疫阻断与免疫治疗联合抗肿瘤血管形成治疗哪一种治疗模式更合适。
此外，单一联合治疗模式在同一种肿瘤的治疗中如何选择，比如当免疫治疗联合化疗用于肺腺癌的化疗药物选择上，使用培美曲塞联合免疫治疗还是白蛋白结合型紫杉醇联合免疫治疗。再比如在具体的免疫治疗药物的选择上，在肾细胞癌的治疗上，使用axitinib阿西替尼联合帕博利珠单抗还是阿法木单抗,单一联合治疗模式与其它治疗模式如何选择等一系列问题，。
据有限，对这些问题，目前显然没有明确的结论，也只有等待未来的研究进一步回答。不管怎样，联合治疗相比于单药而言，在提高疗效的同时，也将会不可避免的引起毒副反应以及治疗费用的增加，这一点也是临床使用联合治疗需要重点关注的问题。
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