对于晚期不可切除的原发GIST 可首选格列卫治疗，初始剂量400 mg/d。格列卫治疗可能使肿瘤缩小，甚至达到手术切除的标准。对于复发和转移、特别是对格列卫继发耐药的晚期GIST，综合文献报道和经验，选择外科手术联合酪氨酸激酶抑制剂治疗，根据病人的不同情况，制定个体化综合治疗方案，可提高总生存期。
如果肿瘤完整切除后的GIST 病人未进行系统的格列卫治疗，而肿瘤复发和转移，建议先口服格列卫400mg/d，结合治疗效果、肿瘤的基因状态和可切除性等方面考虑是否手术，如果行手术切除，手术时机尽量选取在格列卫充分发挥疗效、产生继发耐药之前，术后继续格列卫或舒尼替尼治疗。如果病人在系统的格列卫治疗过程中发生肿瘤复发和转移，应视为格列卫继发耐药，如肿瘤仍可完整切除则行再次手术，切除复发和转移病灶，可以延长病人的生存时间。
如肿瘤无法切除则应将格列卫治疗剂量加至600mg/d和800mg/d，或改用舒尼替尼治疗，如果病灶缩小明显并达到可切除标准，还可考虑手术切除，术后继续口服格列卫或舒尼替尼。临床发现，国内病人常难以耐受格列卫800 mg/d，600 mg/d 和800mg/d 的治疗剂量对于国内进展期GIST病人，疗效无明显差异。治疗中应根据病人的个体情况，选择恰当的格列卫剂量，寻求合适的时机更换舒尼替尼治疗。对于格列卫治疗失败的GIST，舒尼替尼是目前惟一被批准作为二线药物的酪氨酸激酶抑制剂。
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