阿法替尼可用于治疗铂类化疗时或化疗后病情恶化的晚期肺鳞癌，阿法替尼作用不可逆，与EGFR结合后不会解离，能够针对EGFR家族的其他突变，或具较广的抗肿瘤活性。肺鳞癌的预后较差、生存期有限，并伴随咳嗽和呼吸困难等症状。晚期肺鳞癌确诊后的中位总生存期约为1年。有研究发现，阿法替尼能将患者的中位总生存期延长至7.9个月，死亡风险降低了19%，而厄洛替尼近将患者的中位总生存期延长至6.8个月。接受阿法替尼治疗患者的中位无进展生存期为2.6个月，而接受厄洛替尼治疗患者的中位无进展生存期为1.9个月。
阿法替尼与与厄洛替尼相比，阿法替尼有以下优点：1、可显著延迟肺癌进展，可使癌症进展风险降低19%。2、可显著改善总生存期，可使死亡风险降低19%。3、可显著改善疾病控制（51%vs40%）。4、可提高生活质量和对癌症症状的控制。阿法替尼与厄洛替尼相比，阿法替尼组的重度腹泻和口腔炎（口腔溃疡）的发生率高于厄洛替尼组，而厄洛替尼组的重度皮疹/痤疮的发生率高于阿法替尼组。
另一项阿法替尼与化疗方案相比：临床试验：共631名伴有EGFR常见突变的患者，419例接受阿法替尼作为一线治疗，212例接受标准化疗方案治疗。结果：36.5个月后随访，阿法替尼组中位总生存期为27.4个月，标准化疗方案为24.3个月。而阿法替尼对其中含有EGFRDel19突变患者死亡风险比不含EGFRDel19突变的患者死亡风险要低41％，也就是说，阿法替尼对存在EGFRDel19突变的患者受益更多。阿法替尼组毒性反应比例较标准化疗组更低（7.9%对11.7%），且患者报告生活质量更佳，这可能是因为阿法替尼较好地控制了咳嗽及气促症状。
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