最初将两个治疗组一起考虑,总体而言,与第1天相比,治疗结束时检测到的突变更多,第1天有105位患者进行了183次变异检查,而治疗结束时119位患者进行了243次变异检查。 60名患者在治疗结束时至少有一个新发现/获得的突变。在治疗结束时获得突变似乎并未反映出低的第1天肿瘤含量,因为在有和没有获得性突变的患者中,检测到的第1天突变的比例相似。此外,使用SNP专家组计算得出,基线时肿瘤纯度> 10%的患者比例没有显着差异(获得性突变的患者为20.8%,无突变的患者为31.0%,p=0.21,Fisher精确检验)。 n=163天1个样本的子集。在两个治疗组中,获得至少一种新突变的患者比例相似,帕博西尼加氟维司群组为39/127(30.7%),而安慰剂加氟维司特组为21/68(30.9%)。
6名患者在治疗结束时获得了可检测的RB1突变(p=0.041,采用连续校正的McNemar测试),所有这些患者均接受了帕博西尼(爱博新)加氟维司群。这6例患者中有2例具有2个RB1畸变,先前已通过外显子组测序鉴定出1例患者,提示多克隆耐药亚克隆。样品418中鉴定的Q257X突变也用ddPCR进行了验证。在获得RB1像差的6例患者中,所有8个变体都是终止密码子增加或移码缺失,极有可能导致Rb功能丧失。发生RB1突变的6名患者中有4例也具有较高等位基因分数的PIK3CA突变,这表明RB1突变可能反映了亚克隆。考虑到扩增子和外显子组捕获这两种正交测序方法,在帕博西尼加氟维司群中在治疗结束时鉴定出相似的治疗结束RB1突变频率。这些观察结果支持在帕博西尼的压力下获得或选择RB1像差的出现,但仅在少数患者中(6/127,4.7%)。尽管我们在第1天没有发现任何RB1突变,这是偶然的结果,但我们在331天的第1天样本中(其中包括没有EOT样本的患者)在2组患者中发现了RB1突变。
除了在帕博西尼上出现RB1突变外,通过治疗对变异的分析还揭示了不同基因的不同模式,但治疗组之间的模式相似。对于TP53,在第1天主要存在变体的持久性/维持性,与这些基因中通常代表截短变化的变体一致。一名第1天TP53突变的患者在EOT时获得了TP53中8个新可检测到的变异
对于PIK3CA,考虑到两个治疗组,在第1天的样品中发现了37例患者中的39个变异体,与先前的发现一致,表明多克隆水平较低。在治疗后第1天几乎所有的PIK3CA突变都得以维持(37/39,95.7%),与大多数突变(克隆/截短突变)一致。在治疗结束时,在两个治疗组的52位患者中检测到55个PIK3CA变体,与第1天相比有所增加。总体上有8.2%的患者获得了PIK3CA突变(16/195,其中一个获得了2个单独的突变,另一位患者获得了另外的PIK3CA变体。和E542K(最常见,占获得的16/18变异),其中100%(16/16)验证并显示与测序等位基因分数估算值密切相关(r=0.97)。 ,只有有限的证据可以肯定地选择E542K(p= 0.041,带连续校正的McNemar检。使用数字PCR测试第1天的样品,少数获得的PIK3CA突变。在第1天具有通过数字PCR可检测到的“获得性”突变(6/18,33.3%,),其中大多数处于非常低的等位基因频率,低于ctDNA测序的检测极限,在某些患者中有证据表明已经存在一个较小的PIK3CA突变体亚克隆。在分析中,包括第1天的数字PCR数据在内的分析显示,治疗结束时PIK3CA突变患者比例的增加仍然具有统计学意义。帕博西尼对于乳腺癌的效果现在也是非常的不错,如果您有需要购买,可以添加我们康安途的微信,我们能提供非常正规的购买。
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