如何预测PD-1抑制剂的疗效？对于大部分实体瘤，PD-1抑制剂的有效率只有20%左右。那么，如何精准的筛选出来这20%的患者呢。2017年，在寻找PD-1抑制剂预测指标方面，除了传统的PD-L1检测和MSI检测，又有一些新的指标：肿瘤的基因突变越多，产生的异常蛋白质就可能也越多，因此就有更大的可能性激活免疫系统。因此，一直以来，学术界都认为直接测定肿瘤组织中的突变数量，也就是所谓的肿瘤突变负荷，tumor mutation burden，TMB，是可以预测PD-1抑制剂等免疫治疗的疗效的。
2017年10月份，一项重磅的临床数据公布：科学家检测了211位小细胞肺癌患者的TMB指标，发现：对于TMB高的患者来说：单药使用PD-1抑制剂的有效率21%，生存期5.4个月；PD-1联合CTLA-4的有效率高达46%，生存期22个月；对于TMB低的患者来说：单药使用PD-1抑制剂的有效率5%，生存期3.1个月；PD-1联合CTLA-4的有效率高达16%，生存期3.4个月。所以，这个TMB指标，就很好的区分了有效和无效的患者。
特定基因可能会影响PD-1抑制剂治疗的效果，临床研究发现，这些基因有可能影响PD-1抑制剂治疗的效果。POLE基因突变的子宫内膜癌、非小细胞肺癌和肠癌患者，使用PD-1抑制剂治疗有效的可能性大。一些临床证据提示，MDM2扩增的患者，使用PD-1抑制剂治疗，有可能造成肿瘤的爆发性进展，对患者有害无益。对于有EGFR敏感突变的肺癌患者来说，EGFR抑制剂耐药之后，再使用PD-1抑制剂治疗的效果并不好，还可能造成肿瘤爆发进展。另外，KRAS和PTEN基因的不同变化，也可能在一定程度上影响PD-1抑制剂治疗的效果。
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