在厦门召开的CSCO会议上有相关研究显示：阿法替尼治疗的患者3年治疗应答率较吉非替尼高，即使用阿法替尼治疗无进展生存期明显长于吉非替尼。使用时间长达3年的患者占所有用药者的10%，这是一个相当可观的数据。而其中主要以EGFR基因的19外显子缺失突变的女性患者为主。该研究结果显示：三年内两药耐药率的比较：吉非替尼一年内耐药率为87%，阿法替尼为80%；吉非替尼二年内耐药率为94%，阿法替尼为85%；吉非替尼三年内耐药率为96%，阿法替尼为90%；从上述数据中也可看出阿法替尼使用三年后仍有10%可以继续有效，而吉非替尼仅仅只有4%的人还有治疗效果。
阿法替尼效果毋庸置疑，但为何很多人并不把阿法替尼作为治疗的首选药物，一方面是因为阿法替尼较吉非替尼有更多副作用。当出现无法忍受的副作用时，很多患者不得不选择调整药物剂量来改善，这样会就有很多人会担心疗效是否也随着药物剂量的减少而大打折扣。75%的患者因阿法替尼的副作用而降低了药物剂量，但仍有患者使用阿法替尼有效治疗3年，甚至有患者使用超过6年以上。从以上数据来看适当降低阿法替尼的剂量并不会影响有效性。这些患者的影像学结果显示肿瘤缩小是非常明显的，甚至部分患者的肿瘤是完全消失。
另一方面，有些患者和家属有错误的认识：阿法替尼是二代靶向药物，就应该在一代靶向药物耐药后再使用。这样的想法其实并不对。一代靶向药物耐药后，超过50%的患者是因为出现T790M突变，针对这一突变，最好最有效的药物是三代靶向药物泰瑞莎，而不是阿法替尼。所以，虽然阿法替尼是二代靶向药物，但它的适应症和使用时机基本和一代靶向药物一样，不同的是效果！总体而言，阿法替尼比第一代靶向药物显示出了更长久的有效应答。
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