来那替尼作为小分子药物，安全性问题主要在于同类靶点药物相关的腹泻。由于它的临床研究开展较早，很多医生与患者对腹泻并不了解。很多年前化疗药物CPT-11(伊立替康)在临床试验中出现的致死性腹泻令大家印象深刻，因此很多人对于研究中药物导致的腹泻过度紧张，来那替尼研究初期很多患者因为腹泻的出现便停止用药。实际上现在来看，腹泻经过早期的药物干预和短暂的停药之后，基本上很快消失。ExteNET中如果三个月内停药的话，获益会明显下降。但是如果能够完成11个月以上的用药，获益会非常明显，5年iDFS的HR值能够达到0.67。研究中大部分患者用药能够超过11个月，因此经过妥当的处理之后药物的安全性可观。
在给药时也需要考虑，使用一年赫赛汀之后何时选择更好。这与之前延时使用赫赛汀有所不同。HERA研究发现只要在化疗停止四年之内均可以，但来那替尼的HR阴性亚组要求更高。因为如果延迟至12个月或以上的话，效果就无法体现。但如果在6个月以内用药效果仍然不错。因此HR阴性患者在完成赫赛汀之后半年内开始强化治疗，效果可能会更好。
根据之前同类小分子的经验，拉帕替尼这类药物在早期干预过后，患者基本上能够耐受腹泻的情况，腹泻在来那替尼的临床中不是影响治疗的主要因素，应尽可能完成12个月的强化治疗，保证整体的获益。
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