辅助治疗通常是手术后给予的治疗，术后辅助治疗的主要目的是消灭手术治疗后残余肿瘤细胞及血液中的微转移病灶，降低术后的复发与转移，提高患者的无疾病生存期（DFS）与总生存期（OS）。辅助治疗可能包括放疗、化疗、激素治疗、靶向治疗、免疫治疗或进一步手术治疗。新辅助治疗是指在实施局部治疗方法（比如手术）前所做的全身治疗，目的是使肿瘤缩小、及早杀灭看不见的转移细胞，以利于后续的治疗。新辅助治疗可能包括放疗、化疗、激素治疗、靶向治疗、免疫治疗或进一步手术治疗。最近一项研究证明，靶向药物吉非替尼比目前的标准治疗化疗在预防肺癌患者术后复发更加有效。
吉非替尼辅助治疗可以延缓肺癌术后复发时间。接受吉非替尼术后辅助治疗的患者肿瘤中位复发时间（无疾病生存期，DFS）为28.7个月，而接受辅助化疗的患者DFS仅为18个月。截止至目前，共有76名患者死亡（占纳入患者总数的34.2%）；其中41人为吉非替尼组，另外35人为化疗组。吉非替尼组严重副作用发生率（12%）远低于化疗组（48%）。吉非替尼组患者最普遍的严重副作用是肝酶升高；然而接受化疗的患者组发生的副作用则严重影响患者生活质量，化疗组的主要不良反应包括呕吐、恶心、白细胞减少以及贫血。
肺癌术后不管是选择化疗还是靶向药物进行辅助治疗，其目的无非是最大程度的防止疾病复发，并延长总生存期。如果对特定患者能够在低毒性的靶向治疗下避免疾病复发并延长OS，这就是比较理想的治疗手段和模式，而并非是等到肿瘤复发后再去亡羊补牢。但如果最终不可避免复发，此时就涉及到早用或晚用的问题。
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