CAR-T疗法在临床试验上取得了不错的疗效，但是实际上还有许多问题亟待解决。例如安全性问题：脱靶效应、细胞因子风暴、插入突变等。近期顶尖学术期刊《细胞》上刊登了一项来自波士顿大学Wilson Wong教授团队的重磅研究，它所带来新型CAR-T，能进一步减少CAR-T细胞疗法所带来的副作用。这一被称为“SUPRA CAR-T”改良的新系统能够不断变化，靶向不同类型的癌细胞，同时也能够被不断“开启和关闭”。还有异体移植的可能性：目前在CAR-T应用的CAR-T治疗其细胞来源主要是患者本人，这种方法效率低费用高，因此如何制备通用型CAR-T也是该领域的一个研究热点。
CAR-T细胞治疗作为一种广受关注的新疗法，与疗效同样重要的是副作用的防控。临床试验中不良反应的发生率还是很高的，虽然大部分都可以自行缓解，可是也有部分患者因不良反应而退出临床试验。脱靶效应和细胞因子风暴是CAR-T细胞治疗技术应用过程中的两大安全问题。例如，在采用 CD19-CAR-T 细胞治疗急性淋巴细胞白血病过程中，CAR-T 细胞回输后会在患者体内大量扩增并清除白血病细胞，同时也清除正常 B 细胞，从而发生 B 细胞无能(B 细胞无能可以通过静脉输注免疫球蛋白来纠正)，B 细胞随着 CAR-T 细胞在体内的消退而逐渐恢复至正常水平。如果 B 细胞无能发生在其他难以控制的靶点，其后果将很严重。
因此如何降低脱靶效应，是增加 CAR-T 治疗安全性的一个热点。Michel Sadelain 发表在《Science Translational Medicine》的文章中就采用基于 PD-1 的抑制性 iCAR (iCARs)选择性的限制细胞因子分泌、细胞毒效应及 T 细胞增值，保护正常组织不受 CAR-T 杀伤。为了验证其保护作用，Michel Sadelain 采用 iPS-fib-PSMA+cells(表达 CBL 荧光素酶) 腹腔注射 NOD/SCID/gc 小鼠。通过生物发光可以显示这些细胞形成结节。
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