正在使用两种不同抑制剂卡马替尼(INC280)和特泊替尼进行临床试验,两者均确定了关于MET扩增的不同纳入标准,从公认的扩增到确定确切的MET拷贝数。在此,有45个患者样本,其中包括10个没有MET扩增的样本,5个显示低水平MET扩增的样本,10个具有中水平MET扩增的样本,10个具有MET / CEN7比≥2.0的高水平MET扩增的样本。和10个样本显示出高水平通过MET FISH,MET IHC,ddPCR拷贝数测定,NanoString nCounter拷贝数测定和基于扩增子的平行测序对GCN≥6的MET扩增进行评估。
MET IHC与METFISH的一致性最佳,其次是NanoString拷贝数测定,ddPCR拷贝数测定和定制的基于扩增子的平行测序测定。高级别扩增队列的一致性高于低级和中级扩增队列的一致性。总而言之,当前基于提取的方法无法代替METFISH来检测低,中,高水平MET扩增,因为假阴性结果的数量非常高。仅用于检测基因拷贝数≥6的高水平扩增样品是可靠的替代方法。目前,正在使用两种不同的抑制剂卡马替尼和tepotinib进行临床试验它们都定义了关于MET扩增的不同纳入标准,从证明的扩增到确定确切的MET拷贝数。
这突出显示了在MET指导治疗之前需要进行准确的预测性生物标志物测试,以评估MET过表达和扩增的真实发生率。在这项研究中,将传统的基于玻片的方法FISH和IHC与三种基于提取的方法ddPCR,NanoString nCounter技术和基于扩增子的平行测序(用于检测MET扩增)的结果进行了比较。基于提取的方法的使用不受观察者之间的差异,因为可以应用通过广泛的验证研究明确定义的临界值。此外,可以避免由训练有素的病理学家进行的费力的评估。
根据临床研究的纳入标准,可以使用基于提取的不同技术来代替METFISH或MET IHC。对于仅包括具有高基因拷贝数的MET高水平扩增样品的临床研究,与METFISH相比,NanoString拷贝数测定法提供了最佳结果。但是,该技术受到分析所需的大量DNA的阻碍,而这对于大多数肺癌活检来说是不可用的。
同样对于ddPCR,先前的研究表明ddPCR拷贝数测定与METFISH高水平扩增(MET / CEN7之比≥2)具有很强的相关性,但这与我们的研究相反,在该研究中,只有50%的样品匹配。
但是,在基于提取的技术中,METFISH信号模式中的肿瘤内异质性可能导致MET复制数降低,从而导致假阴性结果。部分地,这先前已被报道。在胃/食道腺癌中还显示,MET扩增在具有不均匀信号分布的肿瘤标本中明显更高,这对于基于提取的技术检测可能是有问题的。此外,在我们的研究中,使用了具有不同DNA质量的FFPE材料,根据制造商的指示,将临界值设置得很高,即基因拷贝数≥2.5,对数log2≥0.5,以减少背景噪声升高引起的假阳性数。现在卡马替尼还是比较建议购买的,更多详情可咨询下方微信。
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