目前靶向治疗对于晚期胃癌中的应用，目前是主要是有两方面：首先是HER-2阳性的胃癌，是一种特别类型的胃癌人群，既往临床试验（ToGa研究）和后来实践当中的临床数据也证实了抗HER-2治疗（赫赛汀）对于HER-2阳性的胃癌的一线治疗是获益的。
另外除了抗HER-2治疗之外，其它在晚期胃癌中相对比较成熟的靶向治疗是抗血管生成治疗，主要证据集中在二线或三线，主要包括国外的雷莫芦单抗单药或者联合紫杉醇在二线治疗的应用，另外中国自主研发的抗血管生成药物-阿帕替尼，也证实在胃癌三线治疗中是可使患者获益。
相对于胃癌治疗，晚期胰腺癌的靶向治疗相对比较悲观，尽管胰腺癌的基础研究进展也比较快，也有明确的基因分型，但目前唯一证实可使晚期胰腺癌患者获益的靶向治疗药物只有厄洛替尼，但是由于OS获益比较少，厄洛替尼也很少被临床推荐。前景方面，主要是基于目前二代测序结果，例如基于测序结果，可发现少数胰腺癌存在驱动基因突变，例如Braf突变，这种人群是可以考虑使用阿拉帕尼。但是需要进一步临床研究证实。
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