对于BRAF基因突变后，使用达拉菲尼曲美替尼等药物治疗耐药的患者，在选择用药之前一定要再次进行一项全基因检测，由于癌症的异质性，及耐药发生机制的复杂性，也能发生其他基因突变，还有其他靶向药治疗的机会。
例如：c-MET扩增，可以选择的靶向药有卡博替尼（XL184）、克唑替尼等；ROS1基因融合，可以选择克唑替尼、艾乐替尼或色瑞替尼等；Her-2突变，可以选择阿法替尼（EGFR、Her-2的双靶点抑制剂）等；Her-2扩增，可以选拉帕替尼、赫赛汀等；KRAS突变，可以考虑选择使用KRAS下游的MEK抑制剂，司美替尼、曲美替尼等；BRAF突变，考虑EGFR抑制剂联合使用BRAF抑制剂达拉非尼或威罗菲尼等；PIK3CA突变，考虑EGFR抑制剂联合使用mTOR抑制剂依维莫司、西罗莫司等。
如果没有靶向药可以用，可以考虑PD-L1检测，免疫治疗（PD-1抑制剂）也是非小细胞肺癌治疗的重要方向。
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