丙肝病毒感染的特征对了解丙型肝炎的流行病学和传播具有重要意义

　　背景:　　

　　新获得性丙型肝炎病毒(丙肝)感染的特征对了解丙型肝炎的流行病学和传播具有重要意义。　

　　客观的描述2000-2013年不列颠哥伦比亚省新获得丙肝感染的丙型肝炎病毒(丙肝)基因型分布。　　

　　方法:　　

　　多年丙肝基因型数据的描述性横断面分析。不同丙肝基因型比例的时间趋势仅为新获得的(突发的)丙肝感染。　　

　　结果:　　

　　在急性病例中，基因1a仍然是主要的丙肝类型(50%)，其次是基因3a(34%)。1b型丙肝下降，而2型丙肝相对稳定。系统发育相关的丙肝毒株群被观察到表明一个共同的感染源。　　

　　结论:　　

　　加强肝炎监测为监测目前在社区流行的不同丙肝毒株提供了一种机制。虽然丙肝基因1a仍然是最普遍的，但已经观察到1型和3型基因相对频率的变化。这可能对控制和预防感染有重要意义。　　

　　丙型肝炎病毒感染(丙肝)是肝脏疾病的一个主要原因，全球患病率为2.8%，影响约1.85亿人。在加拿大，丙肝仍然是一个主要的公共卫生问题。安大略省最近的一项研究根据其对总体传染病负担的相对贡献，将丙肝列为51种病原体中排名第一的。丙型肝炎病毒被归类为Hepacivirus属黄病毒科，具有高度遗传变异的特点。　

　　根据最新的命名法，有7种基因型和至少67种亚型。丙肝基因型根据疾病的地方性和传播途径在地理分布上有所不同。在欧洲，3a基因型在注射吸毒者(PWID)中变得普遍，在某些情况下取代了先前占主导地位的1b和1a基因型。美国和加拿大的研究确定1a是主要的基因型。慢性丙型肝炎患者的早期的基因研究在1990年代在英国哥伦比亚报道，三个主要基因型基因型1例(59.1%)，基因型2(18.2%)和基因型3(22.7%)。有关本研究使用一个基于最新的分类方法中，基因型1a和1b几乎均匀分布(54%丙肝病毒1a和1b分别为46%)。　　

　　感染丙肝基因型和病毒载量水平对干扰素治疗很重要。例如，sofosbuvir对感染基因3型的患者的疗效较差，需要较长的治疗方案(9)。丙肝基因分型作为实验室识别暴发和传播集群的工具也很重要。　　

　　关于加拿大丙肝病毒感染的现有数据是基于强制向加拿大法定传染病监测系统(CNDSS)报告病例，但不能确定事件感染率。加强肝炎毒株监测(EHSSS)，包括收集额外的流行病学和实验室信息，目的是确定突发病例。　　

　　EHSSS于2000年在加拿大西部启动，2004年至2010年间加入了另外7个站点(多伦多、汉密尔顿、伦敦、雷霆湾、蒙特利尔、萨斯卡通和西北领地)。　　

　　本文的目的是描述2000-2013年不列颠哥伦比亚省新获得丙肝感染的丙型肝炎病毒(丙肝)基因型分布。重点是BC省，因为它是唯一一个参与EHSSS的省份，所有人口都被覆盖。　　

　　2000年至2013年，共分析了918份基因型样本；来自VCHA的258和来自BC的660。在急性丙型肝炎病例中，基因1a仍然是传播中的主要丙型肝炎病毒(50%)，其次是基因3a，占新获得丙型肝炎感染的34%。丙肝基因型2和基因型1b在2a+2b和1b的分布几乎均匀，分别为6%和5%。一小部分病例(3%)具有基因型1和3双重感染，这与这两种基因型是最常见的两种基因型相一致。两种地理位置的基因型分布差异无统计学意义。　　

　　2000年全省急性丙肝病例中，1型和3型丙肝基因型平均分布，但在随后的13年观察期内，基因型1显著高于基因型3(p<0.05)。一个显著的例外是2007-2008两年间，基因型1(49%)和3(36%)之间的差异没有统计学意义。另一个重要的观察是基因型3的上升。当比较2001-2006年与2007-2012年期间基因型3的平均比例时，在95%可信水平上观察到统计学上显著的增加。　　

　　第三个最常见的丙肝基因型是2，尽管在整个观察期间它在0%至略高于10%之间波动。然而，由于数量有限，很难评估这一趋势。比较1a和1b基因型发现，1b基因型有减少的趋势，从调查的前三年(2000-2002年)的平均13%下降到最近十年的3%左右，而1a基因型的水平从2000年开始上升，之后保持相对稳定。对两个位点间基因型分布的评价显示出相似的模式，并有轻微的逐年变化。　　

　　基于序列的不同遗传区域的丙肝病毒基因分型可以实现精确的丙型肝炎病毒基因分型和亚分型，还可以进行系统发育分析。即使没有全面的流行病学数据，系统发育分析也可以识别传播集群。当在不同标本中出现相同或几乎相同的序列时，圈出的区域表明从统计学上看，从同一来源传播是可信的。详情请扫码咨询：