丙肝病毒的基因型分析

　　应在开始适当治疗之前确定丙型肝炎病毒的基因型。对慢性丙型肝炎病毒的治疗类型取决于病毒的基因型。与其他基因型相比，基因1型丙肝导致更严重的肝损害，更快发展为肝硬化和肝癌。此外，与基因2型和3.13型相比，基因1型和基因4型感染丙肝的15例患者需要48周的治疗，基因2型和基因3型患者需要24周的治疗。

　　在土耳其，最常见的基因型是基因型1b，其次是基因型1a。Genoypes2a，3a，4，4c的发生率较低。然而，在土耳其安纳托利亚中部的Kayseri市，第二大常见的基因型为4.1，系统发育分析显示，该地区丙肝基因型4d样本与不同地理区域的基因型4d株系相似度为82-95%。根据分子钟分析，4d基因型菌株被认为是30-75年前来到这个地区的。

　　直接序列分析是一种广泛应用的基因分型方法。然而，序列分析有许多缺点。例如，它昂贵、耗时，并且需要有经验的工作人员。因此，半自动系统被广泛使用。基于基因型特异性实时PCR的雅培实时丙肝基因型分析已广泛应用于丙肝基因型分析。

　　较早的研究报道，1b亚型患者的预后较1a亚型患者差。由于1型基因是土耳其以及其他许多国家最常见的基因型，所以分型很重要。Ciottietal.12评估了Abbott实时丙肝基因型II试验和Versant丙肝基因型2.0试验的性能，并报道了两种试验之间的良好一致性。型一致性为95.9%(117/122)，基因1型亚型水平一致性为95.6%(43/45)。

　　然而，2009年进行的一项研究表明，雅培实时丙肝病毒基因型试验未能正确识别约10%的样本中的丙型肝炎病毒基因型1亚型。只有基因型1亚型可以通过雅培实时检测丙肝基因型II。在我们的研究中，通过Abbott实时丙肝基因型II测定和序列分析，100例患者中有70例发现基因1型。两种系统测定丙肝基因1型的一致性为100%。然而，在确定亚型时，五个样本的亚型被Abbott实时丙肝II基因型试验误归为1b基因型。通过序列分析，这5个样本被划分为1a基因型。这种差异在统计学上不显著。

　　Sohnetal.6在66例丙肝阳性样本中评估了限制性片段质量多态性(RFMP)和Abbott实时丙肝II基因型检测的性能。采用RFMP法鉴定1型39例，2型22例，3型5例。除三个样本外，这些结果通常与Abbott实时丙肝基因型II试验相一致。2例样品经Abbott实时丙肝基因型II鉴定为混合基因型(1b+3)，RFMP鉴定为混合基因型1。

　　其中1例采用雅培实时丙肝基因型检测为混合基因型，RFMP检测为2型。此外，他们的研究报告了15份丙肝基因1型样本的亚型结果在两种方法之间不兼容。在我们的研究中，通过雅培实时丙肝基因型II检测，我们没有发现任何混合基因型。基因型2、基因型3、基因型4两种方法结果一致。表明，Abbott实时丙肝基因型II试验和Versant丙肝基因型2.0试验在识别丙肝基因型6方面存在局限性。然而，在我们的研究中，我们没有发现任何基因型6雅培实时丙型肝炎病毒基因型II试验或序列分析。详情请扫码咨询：