摘要:
确定丙型肝炎病毒的基因型和亚型对于选择抗病毒治疗和流行病学研究非常重要。本研究的目的是评估雅培实时丙型肝炎病毒基因型试验在土耳其Kayseri感染丙型肝炎病毒患者的表现。
方法:
2012年6月至2012年12月,我们评估了100例收治的慢性丙型肝炎患者,采用COBAS®AmpliPrep/COBAS®TaqMan®48丙肝检测丙肝RNA水平。丙型肝炎病毒基因分型采用雅培实时检测丙型肝炎病毒基因型。除基因型1外,丙型肝炎病毒基因型的亚型不能通过艾伯特试验确定。测序分析作为参考方法。
结果:
采用两种方法分别对100例患者中的70例、4例、2例和24例患者进行基因型1、2、3、4的观察。两种系统测定丙型肝炎病毒主要基因型的一致性为100%。经Abbott实时丙肝基因型II检测,70例基因型1的患者中,有66例感染了1b亚型,4例感染了1a亚型。
经序列分析,61例感染为1b亚型,9例感染为1a亚型。在确定丙肝基因1亚型时,两种方法的差异无统计学意义(P>.05)。通过序列分析,丙肝基因4型和3型分别为4d亚型和3a亚型。4例患者为2型基因。序列分析显示,其中2例为2a型,另外2例为2b型。
结论:
雅培实时丙肝基因型分析的结果与序列分析一致。然而,进一步优化的雅培实时丙型肝炎病毒基因型II试验的亚型鉴定丙型肝炎病毒是必需的。
丙型肝炎病毒(丙肝)感染是一种重要的传染性疾病,可引起慢性肝病、肝硬化和肝细胞癌。丙肝有7个基因型和80多个亚型。不同的基因型和亚型与不同的地理模式有关。在土耳其,丙肝基因型1是最常见的基因型。在土耳其安纳托利亚中部的卡塞里市,基因4型的流行率高于全国丙肝基因型的平均分布。
在之前的研究中,基因型1和4比基因型2和基因型3对联合治疗更耐药。丙型肝炎病毒基因型的确定对选择抗病毒治疗、决定治疗时间和监测治疗反应非常重要。此外,丙肝基因分型是流行病学研究和追踪感染源的一个重要和必要的工具
DNA序列分析是丙型肝炎病毒基因分型的金标准方法,目前已在大多数实验室得到应用。近年来,针对丙肝基因组不同区域的几种方法已被用于基因分型,如:血清学方法、线探针法、等位基因特异性PCR和限制性片段长度多态性。
Versant丙肝基因型2.0试验是基于5’UTR区和核心区的反向杂交。焦磷酸测序分析是一种基于检测DNA合成过程中焦磷酸释放的实时定量测序分析技术。11Abbott实时丙肝基因型II检测(Abbott,美国)针对5’UTR区域,该区域在丙肝基因型中高度保守,以及NS5B基因,以有效区分1a型和1b型丙肝。
本研究的目的是评估雅培实时丙型肝炎病毒基因型测定在土耳其安纳托利亚中部凯塞里市丙型肝炎病毒感染者基因型分型中的效果。
在本研究中,Abbott实时丙肝病毒基因型测定方法与主要丙型肝炎病毒基因型的序列分析方法具有良好的一致性。虽然雅培实时丙型肝炎病毒基因型分析具有自动化、快速和低劳动强度等优点,但我们建议该系统在丙型肝炎病毒亚型鉴定方面需要改进。详情请扫码咨询:
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