各种疾病的潜伏期长短不一，短者数小时，长者可达数月或数年。如禽类禽流感的潜伏期从几小时到数天，最长可达21天。人类患上禽流感后，潜伏期一般为7天以内。非典型性肺炎的潜伏期一般在4-10天，临床报告最短病例为1天，最长有20天，甚至有极个别病例达到28天。一般认为潜伏期长短与感染病毒的种类或者型别、病毒的致病性、病毒的数量、感染途径、被感染机体的免疫力以及其他非生理因素等有关。那么丙肝窗口期和丙肝潜伏期有什么区别？
以丙肝病毒为例：HCV感染后临床表现一般较轻，常为亚临床型，但输血后感染的潜伏期一般为20天到6个月，也有资料报道2－26周，平均8周。急性感染丙型肝炎病毒后1～3周，输血感染者潜伏期较短为7~33天，平均19天。也有专家指出丙肝潜伏期最高可达20年之久。在此期间它几乎没有任何征兆。不过，无症状并不代表它没有杀伤力。若不及时诊治，6个月后约有75％-85％的丙肝患者会演变为慢性丙肝，其中有10％-30％的患者可能在患病20年左右发展为肝硬化，甚至有3％-10％会演变为致命的肝癌。
其他病毒，比如艾滋病病毒，经输血感染的剂量一般较大，所以潜伏期相对较短，而性接触感染艾滋病病毒的剂量较小，因此潜伏期相对较长。HBV感染后的潜伏期一般为20天至6个月，也有报道28－160天，平均70－80天；HIV感染后1到2个月内可能出现急性的症状和体征，随后进入较长期的无症状期，持续6－15年，平均8－10年，大量输血的可缩短至1－5年。梅毒的潜伏期一般为2－4周。
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