感染丙肝病毒后，大部分人会产生的免疫反应可将感染清除，因此丙肝并不总是需要治疗，而且有些慢性感染者并未出现肝损害。需要治疗丙肝时，丙肝治疗目标是治愈。治愈率取决于若干因素，包括病毒毒株类型以及所采用的治疗办法。为了最大程度提高治愈率，建议到肝病专科医生进行详细检测评估及治疗方案的制定。
治疗丙肝的药物索非布韦，达卡他韦以及索非布韦/来地帕韦联合治疗都属于世卫组织指南中的首选方案，治愈率可达到95%以上。这些药物比老式疗法更有效、更安全且耐受性更好。用直接抗病毒药物治疗可以治愈大多数丙型肝炎病毒感染者，而且治疗时间较短（通常为12周）。
聚乙二醇干扰素和利巴韦林在某些情况下仍可发挥非常有限的治疗作用。丙肝仿制药，由于价格大幅下降，可以为广大低收入人群服务，但需要有专业肝病医生追踪治疗。在全球7100万丙型肝炎病毒感染者中，20%（1400万）知道其诊断结果。在已确诊的患者中有7.4%（110万）于2015年开始治疗。2016年，另有176万人得到治疗，使丙型肝炎根治性治疗的全球覆盖率提高到13%。到2030年，要在全球实现80%的治疗目标，仍有许多工作需要去做。
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