丙型肝炎是在全球范围内危害比较严重的一类疾病，而我国丙型肝炎患者在其中所占比例最高，人数最多。虽然丙型肝炎的治疗在国际上进展很好，多数患者已经能够达到临床治愈水平；但是在我国，丙肝的治疗仍面临三大挑战：第一，丙型肝炎的筛查率和治疗率低。丙型肝炎在治疗方面，目前治疗效果很好，治愈率可高达90%，但接受治疗的人群却较少。据国家卫计委统计，2013年传染病报告例数为203155，推算诊断率为2%；也就是我国目前仅有2%的丙肝患者接受治疗，可谓“冰山一角”。
第二，丙型肝炎的治疗不规范。部分地区，由于存在用药不规范的问题，如用药疗程不足、对副作用的处理不及时、未根据应答指导治疗，以致患者治疗效果不佳或停药后复发。因此，加强丙型肝炎治疗的规范性是我国目前面临的第二个重大挑战。此外，目前国际上已有部分抗丙型肝炎的小分子药物，即直接抗病毒药物（DAAs）上市，且治疗效果很好，但我国尚未有类似药物获得批准用于临床。在这种情况下，如何规范DAAs的购买和治疗，是迫切需要解决的问题。
第三，抗病毒药物的可及性和可负担性不高。在我国很多地区，干扰素和利巴韦林还未被纳入医疗保险报销范围，或者被报销的比例很低，以致很多患者在确诊后未积极接受抗丙型肝炎病毒治疗。此外，部分疗效较好的药物，如DAAs还未在我国上市，且这些药物在国外非常昂贵，周边某些地区虽然比较便宜，但是未来在我国上市后的价格如何，尚不确定。因此，提高抗病毒药物的可及性和可负担性是我国丙肝的治疗面临的第三大挑战。
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