我国一直被称为乙肝大国，实际上我国丙肝患者的数量也不容小觑，所以针对丙肝的治疗显得尤为迫切，为什么丙肝的治疗如此艰难呢？因为目前还没有疫苗能预防丙肝病毒感染，因此丙肝抗病毒治疗关系重大。然而丙肝的治疗效果受宿主和病毒等多种因素的影响，因此在治疗之前必须进行病毒基因分型的检查，不同基因型的治疗方案和判断预后有显着差别。
丙肝病毒特别狡猾。它把重要的基因隐藏起来保持其相对稳定，把免疫系统能够发挥作用的基因抗原放在容易发生变异的位置，导致病毒在复制过程中像孙悟空七十二变一样不停地发生变异，目前丙肝病毒发现了6种基因型，这些基因型至少包括68个亚型。机体免疫系统对原病毒抗原产生的抗体，在迅速突变的新病毒株面前很快失效，再产生新的抗体时，病毒又发生了新的变化，从而逃避了人体免疫系统的清除。因此，至今没有研究出预防丙肝病毒感染的疫苗。
丙肝病毒损害肝细胞的手段比乙肝病毒更多。丙肝病毒既可以像乙肝病毒一样刺激免疫系统，挑起战争，还能直接破坏肝细胞造成肝损害。不仅如此丙肝病毒还会改变人体代谢，导致糖代谢、脂代谢紊乱，引起肝细胞脂肪变性，就是说它作恶不仅限于肝脏。丙肝病毒核心抗原与人体细胞核的一种多肽抗原十分相像，免疫系统常常误把人体细胞核的多肽抗原当成丙肝病毒核心抗原，结果没有清除病毒反而伤了自身细胞，引起自身免疫性损伤和相关疾病。
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