丙型肝炎病毒(丙肝病毒)在RNA病毒中是独特的，能够在大多数暴露的成人中建立慢性感染。尽管干扰素(IFN)刺激基因(ISG)诱导，HCV仍然存在于肝脏中；强大的诱导实际上预示着治疗失败和病毒持续性。尚不清楚哪种形式的HCV RNA与天然感染期间的ISG诱导和IFN抵抗有关。为了彻底描绘HCVRNA群体，我们研发了完全分离双链长链RNA（dsRNA）的条件，并允许在逆转录/聚合酶链式反应测定中定量释放的RNA。
这些方法揭示了dsRNA［病原体相关分子模式(PAMP）］在慢性丙肝感染患者的肝脏中包含52%的HCV RNA(标准偏差，28%)。HCV dsRNA在不利的IL28B TT(rs12979860)基因型的患者中有更高的比例。HCV双链与单链RNA(ssRNA)的高比例与ISG诱导正相关。在Huh-7.5细胞中，干扰素治疗通过RNA从头合成的过程来增加HCVdsRNA的总量，并且改变病毒dsRNA/ssRNA的比率对增加dsRNA量是有利的。
这种转变被利巴韦林(RBV)阻断，RBV是一种减少丙型肝炎病毒患者复发的抗病毒药物。Northern杂交确定HCV dsRNA包含基因组长度减去链长度。结论：HCV双链RNA是丙型肝炎病毒感染肝脏中的主要形式，具有PAMP和基因组储库的特征。干扰素治疗增加而不是降低HCV dsRNA。这一意外的发现表明，丙肝病毒产生响应IFN的dsRNA可能会产生拮抗抗病毒的作用。
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