索非布韦(SOF)属于核苷类聚合酶抑制剂，但它不抑制人类DNA和RNA聚合酶，也不是线粒体RNA聚合酶的抑制剂，不良反应少见，少数患者有轻度疲劳和头痛。在动物试验中，索菲布韦没有遗传毒性和生殖毒性，属于妊娠期安全程度B级药物。因此，索非布韦不良反应发生率低，适用于所有丙肝病毒感染者，包括艾滋病和丙肝病毒共感染者，肝硬化、肝细胞癌和准备肝移植的患者。
索非布韦单药治疗12周的临床试验中未发现与药物相关的不良反应，索非布韦联合干扰素和利巴韦林治疗期间的不良反应一般都是由Peg-IFN或/和利巴韦林所致。即使索非布韦与Peg-IFN或/和利巴韦林联合治疗，由于大大缩短了疗程，患者的治疗依从性也明显优于Peg-IFN联合利巴韦林方案，因不良反应而中断治疗的患者明显减少。
索非布韦的推荐剂量为400 mg，每日1次口服。它的吸收率和生物利用度不受食物影响，因此不必像蛋白酶抑制剂那样要求在进餐前后服用。但与高脂饮食同时服用可减慢药物的吸收，因此最好空腹服药。索非布韦主要通过肾脏排泄，治疗期间应注意监测肾功能。少数药物与索非布韦有相互作用，如： 抗癫痫药(如卡马西平、苯妥英钠、苯巴比妥、奥卡西平)、抗结核药(如利福布丁、利福平、利福喷丁)、抗艾滋病病毒的蛋白酶抑制剂(如替拉那韦、利托那韦)。
上述药物与索非布韦合用，可降低索非布韦的血药浓度，影响其抗病毒疗效。2015年3月，美国FDA收到9例服用胺碘酮治疗的患者在使用含有索非布韦方案的药物治疗丙型肝炎后发生严重的心动过缓，其中1例心脏停搏死亡，3例需要安装起搏器治疗。因此，美国FDA发出警告，索非布韦与胺碘酮可能有相互作用，导致索非布韦的血药浓度增加，引起心脏毒性。建议索非布韦与胺碘酮不要同时服用。
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