帕博西尼/哌柏西利PALOMA-3研究数据情况-康安途海外医疗

　　PALOMA-3试验是一项III期双盲随机对照试验，比较了ER + / HER2晚期乳腺癌患者的帕博西尼（哌柏西利）加氟维司群与安慰剂加氟维司群。该试验招募了521名患者，这些患者以2：1的比例随机分配，每天，连续3周，停药1周或匹配的安慰剂接受口服Palbociclib 125 mg。所有患者每4周接受氟维司群500mg。绝经前妇女还接受了戈舍瑞林。如果患者因内科疾病进展而接受内分泌治疗或在辅助内分泌治疗期间或之后12个月内进展，则符合条件。

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　　在治疗的第1天和治疗结束时，在EDTA血液收集管中收集血样。将它们在1500-2000g的离心力下在30分钟内离心，然后分离血浆并在-80°C下储存并转移到中央实验室。在提取之前，将血浆再次以3000g离心10分钟，并将上清液用于提取。使用来自（Venlo，荷兰）的循环核酸试剂盒（目录号/ ID：55114）进行DNA提取。使用针对一个基于TaqMan的数字PCR分析DNA进行定量RPPH1从LifeTech®。

　　选择第1天和处理结束时匹配的样品，该样品具有足够的材料和纯度（10％）用于外显子组测序。使用Agilent SureSelect V6制备了杂交捕获文库，并在Illumina HiSeq 2500上进行了配对末端测序，血浆的目标深度为150X，种系的目标深度为50X。使用BWA v0.7.12将读数与hg19参考进行比对，并根据GATK最佳做法用Picard删除重复项。使用cnvkit v0.8.4评估拷贝数，并使用ASCAT 2评估纯度。使用MuTECT v1.1.7，MuTECT2（GATK v3.7），VarDict v1.5.0，以及使用MuTect2和GATK在样品与种系之间进行检测。仅当变体的覆盖范围是40倍并且被2个调用者识别时，才考虑变体。

　　设计了1729个扩增子定制面板，以进行组合的拷贝数和纯度评估。为了进行纯度评估，该小组在8个通常显示杂合性丧失的染色体区域中包括大约100个SNP，其人群患病率超过20％：16q24.3、17p12、8p23.2、11q23.3、22q13.31、1p36.13 ，6q27，3p21.31。通过与经验证的数字PCR分析等位基因分数进行比较，可将肿瘤纯度评估降低至10％。为了可靠地评估损失，使用了类似的方法来包括RB1，CDKN2A（p16）和PTEN分别具有119、134和128个SNP。为了进行拷贝数评估，在乳腺癌中通常扩增的11个基因和从TCGA和METABRIC数据中鉴定为相对拷贝数不变的19个参考基因中定位了约20个扩增子。这些阈值是使用平均数的3个标准差确定的，该平均值是使用纯度面板从测序的种系样品中得出的。为了说明组内的基因间变异性，针对所有样品，对局部logR进行了α为0.05的额外z检验。当纯度超过最低阈值10％时，对拷贝数估计值进行纯度调整。捕获CCNE2的引物仅包括226/324个样品，因此在其他98个样品中均无法评估CCNE2。RB1丢失的定义为杂合丢失的证据或可能的纯合丢失，其中调整拷贝数<1。

　　无需进一步PCR的双索引适配器。然后在带P1芯片的Proton上将IonTorrent文库测序到2,000X的目标深度。和手动管理，仅当在两个数据集中存在的热点，停止增益和移码的等位基因分数高于0.3％，而所有其他调用的等位基因分数高于0.3％时，才从堆中调用变体，并且至少有5个替代读物。

　　使用Cox比例风险模型，通过对数秩检验对Kaplan Meier的无进展生存期进行生存分析，以获得风险比和95％置信区间。使用Fisher精确检验比较未配对的第1天样本中特定基因组畸变的频率与治疗结束时的频率。使用McNemar检验对第1天至治疗结束之间的配对数据进行分析，并在需要时进行连续性校正。除非另有说明，否则所有p值均为a值为0.05的两面。使用R版本3.4.3进行统计分析。为了解决第1天时间点的潜在欠采样问题，为了进行生存分析，比较具有和不具有获得性突变的患者，只有在离子洪流库和Illumina库中的变体调用通过了额外的统计测试时，才将其包括为获得性突变。使用Fisher精确检验比较第1天至治疗结束之间替代和参考读物的比例，生存率分析中仅包括两个库中p <0.05的那些调用。在60位获得性突变患者中，有53/60位符合这些标准，并被纳入生存分析。

　　使用该试验的最新数据（2015年10月）进行生存率分析，其中氟维司群加安慰剂的中位PFS为4.6个月，帕博西尼加氟韦司坦的中位PFS为11.2个月在60位获得性突变患者中，有53/60位符合这些标准，并被纳入生存分析。使用该试验的最新数据（2015年10月）进行生存率分析，其中氟维司群加安慰剂的中位PFS为4.6个月，帕博西尼加氟韦司坦的中位PFS为11.2个月（使用Fisher精确检验比较第1天至治疗结束之间替代和参考读物的比例，生存率分析中仅包括两个库中p <0.05的那些调用。在60位获得性突变患者中，有53/60位符合这些标准，并被纳入生存分析。使用该试验的最新数据（2015年10月）进行生存率分析，其中氟维司群加安慰剂的中位PFS为4.6个月，帕博西尼加氟韦司坦的中位PFS为11.2个月。现在帕博西尼的价格多少？更多详情可咨询下方微信。