在用药人群方面，恩替卡韦属于妊娠C类药物，所以对于正在备孕或已孕妇女为了避免对胎儿造成影响，是不能使用的。同时恩替卡韦有可能会通过乳汁分泌，所以对于哺乳期妇女也不建议使用。
而替诺福韦，属于妊娠B类药物，所以对于孕期妇女推荐优先选择替诺福韦进行抗病毒。对于哺乳期这块，我国15年版的乙肝防治指南中只指出：“抗病毒母亲停药后可以母乳喂养。”15年世界卫生组织《预防、关护和治疗慢性乙肝感染者指南》建议：“在发展中国家没有更好可替代的喂养方法时可以服用替诺福韦哺乳。”
虽然替诺福韦抗病毒药效强，安全性也较好，但替诺福韦有轻微的肾毒性，所以对于有肾炎的患者须慎用该药。对于肾功能正常的用户则可以放心使用，即使长期使用导致肾损伤也是可逆的。停药或调整药物剂量，或者给予补磷治疗，都会完全好转。长期治疗期间只要定期监测肾功能和血磷，都不会有大问题出现。
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