TAF最常见的副作用是头疼、胃痛、疲倦、咳嗽、恶心和背痛。其他副作用：1. 可能产生新的或者出现更糟糕的肾脏问题，包括肾衰竭。需要由专业的医生进行血液和尿液检查来检查患者的肾脏。如果患者有了这些的问题，医师会让患者停止服用TAF。患者在开始服TAF前和进行乙肝治疗期间，都需要评估体内的血清肌酸酐和血清磷含量，估算出大概的肌酐清除率、尿糖和尿蛋白。如果一旦发生肾功能的临床意义出现显著的降低或范科尼综合征的前兆，应该要立即终止TAF治疗。
2. 患者血液中的乳酸过多 （乳酸性酸中毒），这是一种严重但罕见的医疗紧急情况，可能导致死亡。如果患者有这些症状，请马上告诉患者的专业医师：无力或比平常更累，不寻常的肌肉疼痛，呼吸短促或呼吸急促，伴有恶心和呕吐的胃痛，感冒或手脚变蓝，感到晕眩或头晕，或心跳快速或异常。3.非常严重的肝脏问题， 极少数情况下可能导致死亡。4.如果患者有这些症状，请马上告诉患者的专业医师：皮肤或眼白变黄，深色的「茶色」尿液，浅色大便，食欲不振数天或更长时间，恶心或胃部疼痛。
5.乙型肝炎感染恶化。由于乙肝是无法完全治愈的，所以需要患者长期的服用。如果患者服用TAF后停用，患者的乙型肝炎(HBV)感染有可能会变得更加的糟糕（即严重急性恶化）。所以患者在停用TAF之前，最好先咨询专业的医生。在终止TAF治疗后，医生还需要随访数月，并且从临床和实验室两方面对患者进行严密的监视。如果需要，可以恢复抗乙肝治疗。
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