现有药物难以达到治愈慢性乙型肝炎的目标，所以患者需要长期甚至终生治疗，因而面临耐药及停药复发等问题。在恩替卡韦片上市后，美国FDA对其致癌性进行了专门的的临床观察。2006年在全球发起了一项代号为“080”的大规模多中心临床试验，包括我国在内的许多国家上千万名患者参加，对比恩替卡韦和其他核苷（酸）类药物治疗慢性乙型肝炎的疗效和肿瘤发生率。
目前这项试验已经进行8年，研究结果显示，长期服用恩替卡韦治疗不仅疗效优于服用拉米夫定、阿德福韦酯或替比夫定的患者，而且非常安全；与其他药物相比，没有增加肝脏或其他部位肿瘤发生的风险。因此，目前的研究和临床数据表明，长期服用恩替卡韦治疗慢性乙型肝炎是很安全的。
恩替卡韦不能与食物一起吃，因为降低药物的吸收，使血液浓度明显降低，所以需要空腹服用。恩替卡韦与阿德福韦酯和替诺福韦无相互作用，可以一起服用。目前还没有发现不能与恩替卡韦一起服用的药物，因此，在服用恩替卡韦期间若发生其他疾病无需中断治疗。
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