口服核苷（酸）类药物耐受性良好，不良反应较少，但长期治疗仍需监测其可能存在的潜在风险。目前替诺福韦酯已被报道能引起肾损害，多见于具有肾脏疾病风险因素的慢性乙型肝炎患者，包括糖尿病、艾滋病病毒或丙型肝炎病毒合并感染、基线肾功能不全及其他肾毒性药物同时治疗。
2015年WHO慢性乙型肝炎感染患者预防、护理和治疗指南明确指出，对所有准备使用恩替卡韦和替诺福韦酯治疗的患者在使用前都需要监测患者基础肾脏功能，对肾脏功能损伤风险进行评估，同时在使用抗病毒长期治疗过程中，建议每年都需要进行肾脏功能的监测。
恩替卡韦分散片可以强效、快速抑制乙型肝炎病毒复制，且耐药率低，慢性乙型肝炎初治患者连续治疗5年累积基因型耐药发生率为1.2%。2008年替诺福韦酯被美国食品药品监督管理局批准用于慢性乙型肝炎的治疗，多项研究表明对初治和曾用过核苷（酸）类药物并呈现耐药的慢性乙型肝炎患者，替诺福韦酯抗病毒疗效显著，未发现HBV突破和HBV耐药变异，且安全性和耐受性良好。
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