干扰素治疗乙肝的常见不良反应包括：流感样症候群、骨髓抑制、失眠、抑郁、食欲减退、体重减轻、腹泻、皮疹、脱发和注射部位无菌性炎症等。少见不良反应包括：精神异常、肾脏损害(间质性肾炎、肾病综合征和急性肾衰竭等)、感觉或运动神经病、肠病、肌无力、心血管并发症(心律失常、缺血性心脏病和心肌病等)、视网膜病变、听力下降、间质性肺炎和肝病加重等。所以在治疗期间应该定时检测。
干扰素治疗乙肝前应检测：①生化学指标：包括ALT、AST、胆红素、白蛋白、血糖及肾功能；②血常规；③其他：甲状腺功能和自身抗体，排除甲状腺疾病和自身免疫性疾病；④特殊人群：对于中年以上患者应做心电图检查、测量血压，对育龄女性在治疗前应进行尿人绒毛膜促性腺激素(HCG)检测以排除妊娠。医生需要根据治疗前检查和以往病史决定患者能否使用普通干扰素或聚乙二醇化干扰素治疗。
干扰素治疗乙肝期间监测：①在治疗的第一个月，应每周检查1次血常规和肝功能，以后每月检查1次，直至治疗结束。②肾功能、血糖及甲状腺功能应每12周检测1次。如治疗前就已存在甲状腺功能异常或糖尿病，最好先用药物使疾病得到控制，然后再开始干扰素治疗，并在治疗期间严密监测。③自身抗体应在治疗前和治疗中每24周检测一次，若可疑发生自身免疫性疾病应随时复查。④应定期评估精神状态，尤其是对出现明显抑郁症和有自杀倾向的患者，应立即停药并密切监护。如果疗效差或有严重的、不能耐受的不良反应都应该停药观察，或更换其他抗病毒药物治疗。如果治疗过程中出现不好解释的其他症状或其他异常反应，应及时咨询医生，随时根据情况调整检测时间或增加检测项目，以免发生严重不良反应。
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