慢性乙肝的根本治疗措施是抗病毒，目前推荐的一线慢性乙肝患者的治疗药物有恩替卡韦、替诺福韦和聚乙二醇干扰素，其他可选择的药物还有替比夫定、阿德福韦和拉米夫定。在评价抗病毒疗效时，需要进行乙肝病毒学检测，检测内容包括乙肝五项指标（俗称两对半）和病毒脱氧核糖核酸（即HBV DNA）。乙肝五项指标检测结果常常用阴性和阳性来表示，正常情况下应该全部是阴性。
接种过乙肝疫苗或感染了乙肝病毒并完全恢复者可以出现表面抗体阳性，而慢性乙肝病毒感染者表现为表面抗原和核心抗体持续阳性，同时可能还有e抗原或e抗体阳性。HBV DNA低于检测水平为阴性，高于检测水平为阳性。“乙肝转阴”是临床医生、患者及其亲属普遍关注的问题，但“乙肝转阴”是一个笼统的说法，不同的检测项目有不同的概念，其临床意义也不完全一样。
乙肝表面抗原转阴是慢性乙肝患者治疗的终极目标，由于乙肝病毒的顽固性及药物治疗的局限性，能够达到这一目标的患者微乎其微。虽然近十多年来，随着抗病毒治疗的广泛开展，表面抗原转阴的现象逐渐增多，但在我国庞大的乙肝患者中仍然只占极少数。鉴于此，盲目追求乙肝转阴是不可取的，在治疗上要科学和理智，特别是不要轻信虚假医药广告不切实际的宣传，以免给自己背上沉重的思想负担和经济负担。
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