不该用药时，却用了药。乙肝患者中的80%左右，都是乙肝病毒携带者，尤其是儿童和少年，处于免疫耐受阶段，对于各种治疗无应答，各种乙肝用药都起不到理想的效果，此时大量用药治疗，不仅浪费钱财，还会打破机体免疫沉默状态，使得肝功出现异常，有时这种异常反反复复，缠绵难愈。该用药时，用错了药。不少乙肝患者肝功异常，转氨酶升高，本应是抗病毒治疗的时机，应该使用合适的抗病毒药物，但是却使用起抗肝纤维化药物，使得肝功异常加重。肝硬化腹水，应该加强利尿，补充白蛋白，但是却用上干扰素等抗病毒药物，致使肝功进一步恶化。
药物剂量过大。中药治疗乙肝非常普遍，一些中药处方，个别药味剂量过大，超过国家药典规定的几倍。这些中药超量使用，对于肝脏损害明显，因为使用中药剂量过大，造成药物性肝损害的患者并不少见。对于儿童患者，剂量一定要把握准确，使用任何药物治疗，都需要根据公斤体重数，换算正确的治疗剂量。药物剂量过小。干扰素治疗乙肝的合适剂量是300万～600万单位/隔日，出于对干扰素不良反应的担忧，不少患者使用的剂量偏小，而300万单位/隔日以下的剂量，往往起不到治疗效果，反而会贻误病情，甚至产生耐药性。
用药时断时续，不连贯。乙肝用药不能想起来就吃药，想不起来就断药；这种时断时续的吃药，不能保证药物在血液中恒定和有效的浓度，达不到控制疾病发展的目的。用药疗程不足。乙肝的抗病毒治疗需要时间较长，一个疗程至少需要半年至一年时间，其中干扰素疗程至少为半年，拉米夫定一年以上时间，如果疗程太短，根本起不到抑制病毒的作用。抗肝纤维化的疗程同样需要漫长时间，例如使用复方丹参制剂、复方虫草制剂等等，都需要一年以上时间，短期使用，起不起软化肝脏，降解肝脏纤维组织的目的。
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