吉三代是一个单一片剂，就能彻底治愈丙肝的药，所以患者在吉三代治疗过程中，应停药其它一切非救命药，因为这样可以避免药物的相互作用，不至于降低药效。如果非要吃某种药物，应提前咨询主治医生，查询是否与吉三代相冲，一半来讲，凡不得不使用的药物，主治医师一般会建议两者用药时间间隔四小时以上，若有严重冲突，甚至要间隔十二小时。
1）中药和中成药。这些药里有很多成分极易与吉三代相冲，会降低吉三代的学药浓度，从而影响治疗效果。所以准备服用吉三代的患者，在服用药物前需要停止使用中药及中成药至少一周左右的时间，以确保体内的中药成分被完全代谢掉。
2）护肝、保肝药物极其他一切保健品，包括广泛使用的水飞蓟。因为护肝保肝药物的很多成分都与吉三代药物存在冲突或潜在冲突。丙肝患者的肝脏问题多数是由常年的丙肝病毒引起的，故而、使用吉三杀灭病毒就是对肝脏最好的保护，切不可私自以为服用吉三代的同时使用保肝药物可以得到双重保障。
3）任何含有胺碘酮类的药物。
4）含有连翘片类的药物。
5）利福平：抗结核病药；圣约翰草：中药、多为护肝药；卡马西平：有抗心律失常的作用。这三种药物会降低吉三代血药浓度，影响药物疗效。
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