来自输卵管积水的毒性物质流入子宫腔，对移入宫腔的胚胎产生毒素作用，影响胚胎的发育，降低胚胎种植率及妊娠率，增加流产率。
第二、在超排卵中B超监测可发现少数输卵管积水呈进行性增大，会被误认为发育卵泡，此现象一方面会引起用药误导，提早给予HCG，导致取卵时成熟卵细胞比率下降。在B超监测下经阴道取卵过程中误穿输卵管积水，积水直接污染卵细胞，影响卵细胞受精及受精卵发育。
第三、输卵管积水对子宫内膜容受性的影响：
1.输卵管积水患者其种植窗期子宫内膜β1整合素水平下降，亦可影响子宫内膜容受性。
2.输卵管积水常由感染引起，且多为上行感染，即往的感染可能会造成子宫内膜炎性损害，甚至留下长久性的对胚胎种植容受性的影响。
3.输卵管积水的潴留液流至宫腔，尤其在超排卵时输卵管积水可能增多，流入宫腔的液体量随之增多，造成宫腔积水，能机械性干扰胚胎与子宫内膜的接触。
4.输卵管积水中所含的微生物、碎屑和毒性物质可直接进入宫腔影响胚胎着床，而且输卵管积水的存在使组织释放出细胞因子、前列腺素、白细胞趋化因子和其他炎性复合物，这些物质直接或通过血液、淋巴管转运而作用子宫内膜，参与调节输卵管和子宫运动，从而影响胚胎着床。
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